藤本 健治（ふじもと けんじ、1966年6月12日 - ）は、神奈川県出身の元プロ野球選手（内野手→外野手）。右投右打。父は元巨人投手で後にマネージャーや寮長を務めた藤本健作。
神奈川・東海大相模高から1984年ドラフト6位で巨人入団。1989年は1A・バイセイリア・オークスに野球留学した。1989年より外野手に転向。1993年現役引退。球団広報を経て現在は副寮長。
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